為增進農民福利，維護農民健康，根據行政院指示，參照開辦勞工保險前例，以行政命令訂頌「台灣省農民健康保險暫行試辦要點」，自民國74年10月25日起試辦農民健康保險，由台灣省政府選定組織健全，財務結構良好，人員配置適當及其轄區醫療資源充足的基層農會為投保單位，農民健康保險之被保險人以依農會法第12條規定入會的會員為限，不包括贊助會員，被保險人初次投保無最高年齡限制。對於試辦地區的農民提供了生活保障和醫療照顧，因此廣受農民的歡迎與接納，未參加試辦地區則咸盼早日實施，經奉行政院核定自民國76年10月25日起第2期試辦農民健康保險，擴大投保地區，對初次投保之農民年齡，規定不得超過70歲，但原已加保者不在此限。台北巿、高雄巿及福建省的金門縣、連江縣等地區，奉行政院於民國76年10月25日核准，比照台灣省第2期試辦農民健康保險暫行要點之規定，參加試辦農民健康保險。台灣省政府為貫徹照顧農民之政策目標，復報奉行政院核准，自民國77年10月25日起全面試辦農民健康保險並取消初次投保不得超過70歲之限制，所有農民乃同蒙其惠。

農民健康保險第1期試辦（民國74年10月25日至76年10月24日）保險費率為被保險人月投保金額5%~7%，鑑於農民健康保險係屬試辦性質，衡酌農民的負擔能力，保險費率乃從低訂定為5.8%，農民負擔極低。農民健康保險第2期試辦（民國76年10月25日至民國78年6月30日）保險費率調整為6.5%至8.5%，實施之保險費率訂為6.8%。

農民健康保險試辦期間（民國74年10月25日至78年6月30日）保險費由政府負擔50%，被保險人負擔40%，投保農會負擔10%，保險給付項目為疾病、傷害、生育及喪葬補助費，疾病、傷害包括門診、住院之醫療給付，生育給付本人及配偶分娩均按月投保金額給予2個月之現金給付，喪葬補助按月投保金額給付5個月。

嗣中央根據此項試辦成效，以農民健康保險涉及農民權利和義務，亟宜立法以落實制度，於是制定「農民健康保險條例」經立法院三讀通過，於民國78年7月1日開始實施，本條例為使保險範圍普及，除農會法12條所定之農會會員外，將年滿15歲以上從事農業工作之農民分為自耕農、佃農、雇農及自耕農、佃農配偶4種納為投保對象。

條例中將農民健康保險之保險費率訂為月投保金額6%至8%，核定實施為6.8%，月投保金額依勞工保險前1年度實際投保薪資之加權平均金額擬訂，報請中央機關核定之，核定實施之月投保金額為10,200元，保險費的分擔比例為政府補助70%，被保險人負擔30%，前項政府補助部分由中央主管機關負擔40%，直轄巿負擔30%，省負擔20%，縣（巿）負擔10%。

農民健康保險之保險事故分為傷害、疾病、生育、殘廢及死亡5種，分別給與「醫療給付與現金給付」前者包括傷害給付與疾病給付，後者包括生育、殘廢及喪葬津貼，其中現金給付較試辦期間增列了殘廢給付項目，且喪葬津貼由5個月提高為15個月。

民國84年3月1日，全民健康保險開辦後，醫療給付移撥「中央健康保險局」辦理，農保保險費率改為2.55%。至民國90年1月20日，農會法修正公布，刪除會員雇農之資格，同年5月9日，「從事農業工作農民申請參加農民健康保險認定標準及資格審查辦法」第2條修正公布，刪除非會員雇農資格，在修正前已以雇農資格加保之被保險人，仍得繼續加保，但修正後不得新申請為農會雇農會員或非會員雇農參加農保。