投保單位重複繳納保險費，本局將優先沖抵已逾繳納寬限期之保險費及滯納金，如仍有溢繳款項，將續沖尚未開單月份之保險費，並於繳款單上列示「溢繳沖抵」金額。
單位如欲申請退費，可來電本局保費組保費處理科（分機3302）洽詢。如確有溢繳金額可辦理退費者，可由本局提供或自行下載「勞工保險、就業保險、勞工職業災害保險保險費溢繳退費收據暨申請書」。投保單位只要將前項退費收據暨申請書填妥蓋章後寄回本局，即完成申請退費手續。退費款項入帳或支票寄出約需10個工作天。