一、預防職業病健康檢查全年均可申請辦理，投保單位可視情況分批為所屬合於規定之被保險人提出申請，申請方式如下：
- 網路申辦：於本局e化服務系統登錄申辦。
- 紙本申請方式：
- 被保險人自行申請（投保單位未依規定申請者）：填具「勞工職業災害保險被保險人自行申請預防職業病健康檢查申請書」。
二、依法須實施勞工作業環境監測者，應將作業環境監測結果上傳至勞工作業環境監測及暴露危害管理平台；依法無須實施勞工作業環境監測者，應提供其他相關證明或詳述勞工作業內容、場所、時間等資料。如係職業工會被保險人，請加填「勞工職業災害保險預防職業病健康檢查特別危害健康作業經歷切結書」。
三、勞保局受理申請書件經審查核定後，檢附符合受檢規定之受檢者每人1張「預防職業病健康檢查證明單紀錄表」，請依照核准之檢查類別，至職業安全衛生署網站下載「勞工特殊體格及健康檢查紀錄」，於規定之翌年3月底有效期間內一併攜往勞工特殊體格及健康檢查認可醫療機構受檢。